ИФНС будет начислять налог только в том случае, если ваша доля в праве будет зарегистрирована в ЕГРН. И если даже она и будет зарегистрирована, то налог будет небольшим, так как он будет рассчитываться от кадастровой стоимости недостроенного объекта (квартиры).